Организация, выполняющая функции заказчика, выставляет инвестору счет-фактуру по соответствующему объекту не позднее пяти дней после передачи в установленном порядке на баланс инвестора объекта, законченного капитальным строительством. Счет-фактура составляется в двух экземплярах на основании счетов-фактур, ранее полученных заказчиком от подрядных организаций по выполненным строительно-монтажным работам и поставщиков товаров (работ, услуг). Причем в счете-фактуре строительно-монтажные работы и товары (работы, услуги) выделяются в самостоятельные позиции по каждому подрядчику и поставщику отдельно. К счету-фактуре, который передается инвестору заказчиком, прилагаются копии счетов-фактур, полученных заказчиком от подрядных организаций и поставщиков товаров (работ, услуг), копии соответствующих первичных документов, а также копии платежных документов, подтверждающих фактическую уплату сумм налога таможенным органам.

(Письмо Минфина РФ от 05.12.08 г. № 03-07-09/40).